La pianista guipuscoana obté el primer premi de fi de carrera a Sant Sebastià, amb 16 anys, i recorre les escoles europees més destacades: la CNSM de París amb Dominique Merlet; l’Escola Reina Sofia de Madrid, amb Dimitri Bashkirov; i l’Acadèmia Marshall, amb Alicia de Larrocha. Sempre va obtindre les màximes qualificacions.

Recull importants premis en els concursos internacionals com el de Santander, com a millor pianista espanyola; Darmstadt; Jaén; i Pilar Bayona. La seua vida concertística es desenvolupa en recital o amb orquestres simfòniques com les d’Euskadi, Bilbao, Extremadura, Castella i Lleó, Múrcia, RTVE, Comunitat de Madrid, Galícia, Còrdova, Màlaga, Granada, València, English Chamber, Simfònica de Londres, Simfònica de Berlín, Reina Sofia…, sota la direcció de mestres tan rellevants com Sir Colin Davis, Daniele Gatti, Harry Christophers, S. Comissiona, C. Mandeal, M. Venzago, G. Varga, G. Neuhold, J. C. Spinossi, G. Pelhivanian, J. Mena, Sr. Wilson, L. Pfaff, J. M. Alzinar, J. Amic, M. Bragat, G. I. Ramos, C. Wilkins.

Marta Zabaleta comparteix escenari en música de cambra amb el violoncel·lista Asier Polo, amb el qual va debutar al Carnegie Hall, amb el pianista Miguel Borges Coelho o amb el quartet Ysaye.

Els seus primers enregistraments estan en el mercat: dos amb el segell internacional EMI, de l’obra de Joaquín Rodrigo; un amb el segell suís Claves, el Concierto Vasco per a piano i orquesta d’Escudero; amb el segell RTVE el Concert per a dos pianos de M. Pompey; Goyescas de Granados amb el segell “La mà de guido”; un juntament amb el violoncel·lista Asier Polo amb el segell BBK; i un altre amb el segell IBS Classic.

Actualment és professora en el Centre de Música Superior del País Basc, Musikene, i directora de l’Acadèmia Marshall de Barcelona per desig exprés de la seua antecessora Alicia de Larrocha. Ha sigut convidada com a professora a prestigiosos conservatoris europeus: Hochschule de Colònia, Trinity Laban College de Londres, o en els d’altres continents com el de la Universitat de Bogotà o el d’Auckland (Nova Zelanda).

Ha rebut la medalla Albéniz de la fundació pública Isaac Albéniz.